Nature：风险！微生物组确实泄露个人隐私

起源于生命体唾液的细菌DNA可作为“肠道网纹”（gut print）来比对与生俱来此之前。通过久居某细胞内的病原体DNA可比对成此人的此之前。研究工作管理人员推断成，通过久居药剂的病原体内置DNA，必需特异连续性地比对成与生俱来的此之前，这就消除了与生俱来该软件疑虑。这项推断成刊登于5月底11日的《美国第三世界科医学院期刊》（Proceedings of the National Academy of Sciences）上。文章指成，在一项该网站试验研究工作里，通过寄主于药剂的病原体（即其病原体四组），很有有可能比对成与生俱来此之前，从而泄露某人的生活品质状况、饮食以及种族主义等细节讯息。无独有偶，4月底29日公开发表于《测序研究工作》（Genome Research）的一项研究工作也确信，在由NIH管控的未有更有病原体四组DNA图表里，也含有兼顾潜在比对连续性的生命体DNA。当然，两篇研究实践中均未有依据病原体四组的讯息披露成受测者的履历——据估计目之前为止这么做也亦会很不方便——但他们有重申，这种带有引导连续性的病原体四组研究工作应受益备案。来自康涅狄格州波斯顿哈佛陈曾熙医疗卫生医学院（Harvard T. H. Chan School of Public Health）的推算生物学家Curtis Huttenhower筹划了这项除此以外成炉的研究工作。他坚称，目之前为止，病原体四组的图表管理还偷偷地点儿西部野人的意思。但随着整个行业的发展，人们并不需要切实地似乎，他们的病原体四组带有离地的特异连续性。其实这冤枉并不新鲜，生命体测序研究工作早就因为该软件疑虑受到了数年的非议。2013年，有生物学家宣布，他们能在一项国际连续性的***测序新项目（1,000 Genomes project）里，相符成5位该网站受测者的履历，这是通过参照其DNA以及亲族谱系图表纳（都有年龄、成生地和姓氏）察觉到的。近年来，病原体四组对生命体的生活品质与行为的影响已日趋沦为研究工作的同类型。而生命体病原体四组研究工作所得的图表往往都以未有公开贮存纳作为仍要的归宿，但随着时间的推移，这些病原体四组确实必需经常连续性地比对成所属特定的人，目之前为止已经似乎。Huttenhower的他的团队为了让起源于NIH生命体病原体四组计划（HMP）的未有公开图表，查找采自药剂各个臀部的比对（包括肠道、嘴唇、皮肤和），以将这些同时带有特定比对连续性和时间稳定连续性的病原体遗传基因标上四混搭一起（尽管HMP无法比对成与生俱来履历，但判断成比对的募捐依此（数周之前或数月底之前）还是有可能的。）。则有，唾液比对能缺少最佳的病原体比对标志：在86%的情况下，一与生俱来的首次比对能与其二次比对都是。而皮肤比对能获取精确反之亦然的几率只有大约四分之一。研究工作者还指成，在比对与生俱来方面，基于幼体病原体细菌的DNA标上能充分发挥最佳作用，它比那些基于病原体种类的比对工具要好得多。对于他的团队的实践中，Huttenhower总结道，这应就是“为了让病原体四组图表，通过单一试验，即可非凡连续性地挑战所有疑虑”。他认为，有可能发生的该软件几率漏洞恐怕在于研究工作方案上，比如某人直接参与了两项相同的病原体四组研究工作，若每一四组都含有相异的补充讯息（诸如年龄及生活品质状况），那就有可能注意到泄露。不过，病原体四组本身就有可能消除该软件几率，因为它们某种程度地与生命体DNA纠缠不休。尽管NIH就此竭力探讨如何去除生命体DNA的工具，以防其转到HMP图表纳，但结果更为严重。据加利福尼亚州劳伦斯利弗莫尔第三世界实验室（Lawrence Livermore National Laboratory）的一位推算生物学家、他的团队带头人Jonathan Allen推断成，比对的废水疑虑仍普遍存在。该他的团队认识到，略长串联重复数列（short tandem repeats）一般在相同的人里亦会发生变化，因此在法医学里用做DNA反之亦然。但这种数列若是注意到在病原体四组比对里，确实能构成一个精确的DNA标上呢？Allen坚称目之前为止还无法相符，但它在政府亦会适用连续性DNA图表纳的注意到率的提高增加了这种有可能连续性。《测序研究工作》坚称，只要NIH能从其图表纳里除去未有知的生命体基因数列，那么他们就准许刊登Allen及其他的团队的研究实践中。波士顿测序里心（New York Genome Center）的推算遗传基因学家Yaniv Erlich所带队的他的团队正是在***测序研究工作里比对成了受测者。他坚称，虽然仅基于病原体四组来比对成某人的几率很低，但研究工作者们应该实施适当的安全措施来保护与生俱来该软件。而德克萨斯州丹佛贝勒该医学院（Baylor College of Medicine）的生物学家Amy McGuire坚称，由于直接参与HMP的受测者都已被得悉几率存在，所以他认为，不应亦会注意到针对此冤枉的非理连续性恐慌。但是，反应过份却有可能亦会减缓人们对病原体四组的认识步伐。设在北卡罗来纳州贝凯逾的NIH附属国立生命体测序研究工作所（National Human Genome Research Institute）的政策指导工作Laura Rodriguez坚称，只要保护安全措施到位，比如尽有可能地将生命体DNA从HMP图表纳里去除，那么“我们将借此依然其门上开放，毕竟它能为生物学增添内涵。”更早应是:Ewen Callaway.Microbiomes raise privacy concerns.Nature, May 11, 2015.doi:10.1038/521136a