Cell Res：北京基因组所合作揭示 RNA 甲基化诱导 R -loop 形成及转录终止

R-loop 是一种由 RNA：DNA 杂合链和双螺旋 DNA 组成的特殊核酸本体，在原核和酵母菌脊椎动物的基因组序列中会地理分布相当多且特别是在。R-loop 在很多关键的脊椎动物学更有利于中会发挥重要机制，包括核仁标记、基因组表达催化反应、DNA 损伤修复以及基因组序列可靠性等，但其如何被粗略催化反应的有助于尚能不相符。m6A 标记作为信使 RNA 上丰度最高的标记类型，相当多参与脊椎动物的发育、病原体、细胞培养更新、脂肪变异、以及肿瘤聚合和移到等永生更有利于。然而，现有尚能不相符 m6A 前提能作为 R -loop 中会 RNA 等量的所谓特征来催化反应 R -loop 水平，进而发挥各种脊椎动物学机制。中会科院北京基因组序列数据分析所杨运桂、任捷与清华大学生科院孙前文工作团队密切合作数据分析，找到 m6A 能不稳定的 R-loop 的形成，进而催化反应基因组基因组表达的有效停止。这一全面性以《m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination》为题于 10 月 12 日在线发表于《细胞数据分析》（Cell Research）新闻周刊。数据分析工作团队首先通过斑点分子杂交和病原体荧光技术，找到敲低 m6A 的大基移到酶 METTL3 显着下降 R -loop 水平，且该催化反应作用依赖于 METTL3 的大基移到酶活性。随后，工作团队成员利用高效反应物色谱合组质谱法技术，找到相较于染色体结合的 RNA（caRNA），R-loop 的 RNA 等量有更加硫化物的 m6A 标记。有利于利用基于双螺旋 DNA 建库的 DNA：RNA 杂合链病原体共五沉淀高通量测序技术（ssDRIP-seq），找到下调的 R -loop 主要硫化物在基因组表达停止地带，R-loop 变化程度与 m6A 的东北方和标记水平相关。为了探索 m6A 对 R -loop 催化反应的脊椎动物学机制，数据分析工作团队绘制了 RNA 聚合酶基因组表达位点的高分辨率图解，并在 MYC、ACTIN 基因组上顺利进行多种基因组表达活性检测，找到 m6A 促进 R -loop 形成是基因组表达停止阶段的关键步骤，可以能避免 RNA 聚合酶的基因组表达通读。之前，工作团队成员相结合了针对基因组表达通读的报告基因组的系统，通过 m6A 标记位点的突变有利于推测 m6A 对于 R -loop 形成及基因组表达停止的关键作用。该数据分析找到了 m6A 的大基化标记的共五基因组表达催化反应机制，揭示了 RNA 的大基化标记对核仁本体的阻碍，以及 R-loop 本体中会的 RNA 等量被标记后对其自身稳态的催化反应有助于，阐释了 m6A 通过不稳定的 R-loop 而促进基因组表达也就是说停止的现像，为有利于数据分析 m6A 与 R-loop 的催化反应有助于和适当脊椎动物学机制提供了也就是说的技术和理论支撑。该数据分析给与了中会国科学院战略性先于科技专项、国家政府自然科学以及国家政府重点研发计划等基金资助。早期出处：Xin Yang， Qian-Lan Liu， Wei Xu， et al. m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination. Cell Research (2019).